Le variant Omicron du SARS-CoV-2, aussi appelé lignée Pango B.1.1.529 ou identifiant GISAID GR/484A1, est un variant du coronavirus responsable de la Covid-19. Nommé d’après la lettre grecque Omicron, le premier cas de ce variant est détecté le 9 novembre 2021 au Botswana. Le 26 novembre 2021, il est classé comme variant préoccupant par l’Organisation mondiale de la santé.
Ce variant possède un nombre inhabituel de mutations, dont plusieurs inédites ou affectant le péplomère. Ces caractéristiques rendent le variant Omicron préoccupant quant à sa transmissibilité ainsi qu’à l’efficacité du système immunitaire ou des vaccins à son égard. En conséquence, plusieurs restrictions d’entrées de voyageurs provenant des pays où il a été détecté ont été mises en place au niveau international afin de limiter sa propagation.
Le premier spécimen du variant Omicron est recueilli le 9 novembre 2021 au Botswana. Il est également détecté en Afrique du Sud et à Hong Kong chez un voyageur de retour d’Afrique du Sud. Un autre cas est identifié en Israël chez un voyageur de retour du Malawi en compagnie de deux autres provenant d’Afrique du Sud et de Madagascar. Un cas est également détecté en Belgique chez un voyageur qui l’aurait possiblement attrapé en Égypte avant le 11 novembre.
Les quatre premiers cas rapportés au Botswana, ainsi que les trois confirmés et suspectés en Israël, proviennent de personnes entièrement vaccinées.
L’OMS a déclaré que la nouvelle souche sud-africaine de coronavirus B.1.1.529 était une “variante préoccupante” et l’a nommée “omicron”, en omettant la lettre grecque “nu”.
L’OMS a déclaré dans un communiqué que la décision d’inclure l’omicron dans la liste des “options préoccupantes” a été prise sur la recommandation d’un groupe consultatif d’experts, qui “est basée sur les preuves présentées de son impact négatif sur l’épidémiologie de COVID 19.”
L’OMS explique que la souche B.1.1.529 a été détectée pour la première fois en Afrique du Sud le 9 novembre. Son apparition a coïncidé avec une nouvelle forte augmentation de l’incidence après les trois dernières vagues de COVID. “La variante a un grand nombre de mutations, et les données préliminaires indiquent un risque accru de réinfection chez ceux qui ont eu cette variante”, par rapport à d’autres souches.
L’Afrique du Sud a trouvé un moyen de diagnostiquer rapidement la variante “omicron” sans séquençage génétique complet qui est l’un des types de tests PCR réglé pour reconnaître certains gènes du coronavirus, mais qui ne “ne voit pas” l’un des gènes analysés, et un tel résultat de test avec la “perte du gène S” permet de diagnostiquer précisément la souche “omicron”.
Le Premier ministre Bennett a annoncé aujourd’hui qu’Israël achète de toute urgence des dizaines de millions de tests PCR de cette variété, qui permettront de suivre rapidement la propagation de la variante omicron sans séquençage génétique coûteux.
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